FASTA formaat | |
---|---|
Failinimelaiendid |
.fasta, .fas, .fa, .fna, .ffn, .faa, .mpfa, .frn |
Arendajad |
David J. Lipman William R. Pearson |
Avaldatud | 1985 |
Valdkond | Bioinformaatika |
Laiendatud versioon | FASTQ formaat |
veebileht |
www |
Bioinformaatikas on FASTA tekstipõhine formaat, milles nukleotiidide või aminohapete järjestused esitatakse nendele vastavate ühetäheliste koodide järjestusena. FASTA formaadis järjestus algab ühe kirjeldava koodireaga millele järgnevad read järjestuseandmetega. [1] FASTA formaat võimaldab lisada järjestusele täpsustavaid identifikaatoreid. [2]
FASTA formaat loodi David J. Lipman ja William R. Pearson’i arendatud FASTA tarkvarapaketi raames, mida kirjeldati esimest korda 1985. aastal.[3] Sellel põhjusel nimetatakse FASTA formaati alternatiivselt ka Pearson’i formaadiks.
© MMXXIII Rich X Search. We shall prevail. All rights reserved. Rich X Search